Organické doplnky sú určené na podporu výživy a biologickej stability v akváriu, najmä vtedy, keď chcete zlepšiť kondíciu koralov alebo pracovať so živinami kontrolovanejšie. Patria sem rôzne formy organického uhlíka a výživové doplnky, ktoré môžu podporiť bakteriálnu aktivitu, zlepšiť čistotu vody a pomôcť dosiahnuť vyváženejší pomer živín. Pri výbere sa oplatí zamerať najmä na to, či chcete doplnok používať na podporu koralov alebo na riadenie NO3 a PO4, a dávkovať postupne s pravidelným meraním.